En 1914, el joven lingüista y cartógrafo2 Milo James Thatch (Michael J. Fox) está decidido a continuar con la investigación que su ahora fallecido abuelo, Thadeus Thatch, llevó a cabo sobre el continente perdido de la Atlantida. Pero tendrá que enfrentarse a distintas dificultades, entre ellas la falta de fondos para realizar una expedición y el escepticismo de los funcionarios del Museo de Washington. Tras este fallo, se dirige desilusionado a su departamento, pero dentro de este conoce a la misteriosa y seductora Helga Sinclair, quien lo convence de aceptar una "propuesta" (nunca menciona cuál en ese momento). Después Milo descubre que Helga trabaja para Prestone Whitmore, un viejo amigo de su abuelo. Ante su sorpresa, obtiene durante la charla con Whitmore financiación para realizar una expedición inmediata para encontrar la Atlántida, además que encuentra "El Diario del Pastor", la clave para encontrar la famosa ciudad perdida, todo esto gracias a que cuando su abuelo aún vivía, hizo una apuesta en la cual si su abuelo hallaba el diario en la costa de Islandia (al inicio de la cinta se observa a Milo ensayando para presentar una ponencia ante los funcionarios del museo, corrigiendo la creencia de que el diario se encontraba en Irlanda), Whitmore financiaría la expedición.

En 1914, el joven lingüista y cartógrafo2 Milo James Thatch (Michael J. Fox) está decidido a continuar con la investigación que su ahora fallecido abuelo, Thadeus Thatch, llevó a cabo sobre el continente perdido de la Atlantida. Pero tendrá que enfrentarse a distintas dificultades, entre ellas la falta de fondos para realizar una expedición y el escepticismo de los funcionarios del Museo de Washington. Tras este fallo, se dirige desilusionado a su departamento, pero dentro de este conoce a la misteriosa y seductora Helga Sinclair, quien lo convence de aceptar una "propuesta" (nunca menciona cuál en ese momento). Después Milo descubre que Helga trabaja para Prestone Whitmore, un viejo amigo de su abuelo. Ante su sorpresa, obtiene durante la charla con Whitmore financiación para realizar una expedición inmediata para encontrar la Atlántida, además que encuentra "El Diario del Pastor", la clave para encontrar la famosa ciudad perdida, todo esto gracias a que cuando su abuelo aún vivía, hizo una apuesta en la cual si su abuelo hallaba el diario en la costa de Islandia (al inicio de la cinta se observa a Milo ensayando para presentar una ponencia ante los funcionarios del museo, corrigiendo la creencia de que el diario se encontraba en Irlanda), Whitmore financiaría la expedición.